روعي في تصميم مصنع ورق قنا أن تكون حماية البيئة أحد الدعائم الأساسية في إنشاؤه طبقا للمواصفات العالمية، فقد تضمن المصنع أقسام الاسترجاع الكيماوي حيث يتم فيه التخلص من السائل الأسود الناتج من العملية الصناعية لإنتاج اللب، بالإضافة إلي تدوير الصودا الكاوية، لإعادة استخدامها، وكذلك إنتاج طاقة حرارية يستفاد بها نتيجة حرق السائل الأسود المركز.
ويعتبر أسلوب تركيز السائل الأسود من أحدث الأساليب الصديقة للبيئة ، كما تم تصميم عمليات إنتاج اللب وتبييضه لتكون صديقة للبيئة باستخدام طريقة الصودا بدلا من الكبريتات وكذلك ثاني أكسيد الكلور بدلا من غاز الكلور في عملية التبييض، وهي أحدث الطرق العلمية المطبقة في السنوات العشرة الأخيرة طيقا لتعليمات أجهزة حماية البيئة.
جدير بالذكر أن الطاقة الإنتاجية السنوية للمصنع تبلغ 120 ألف طن ورق كتابة وطباعة وصحف، كما أن قيمة الإنتاج السنوي تبلغ 400 مليون جنيه ، وتصل التكلفة الاستثمارية 1300 مليون جنيه، كما تم بدء تجارب التشغيل في يناير من عام 2001.